DOM level3 に対応したブラウザで使える、 javascript の document.evaluate であれば、XPath ですべてのコメントを抜き出すときに、
var result = document.evaluate("//comment()", document, null, XPathResult.ORDERED_NODE_ITERATOR_TYPE, null);
等としておけば問題ないが、一部の HTML パーサでは、HTML の DOCTYPE 宣言もコメントとして扱ってしまうものがある。
…と言うより、 "<!" で始まって、">" で終わるものはすべてコメントとして扱ってしまうような場合について。